炎性體PCR芯片 Inflammasomes PCR Array
炎性體PCR芯片 炎性PCR芯片檢測84個關鍵基因的表達，包括炎性體相關基因，先天免疫的蛋白復合物，以及一般的NOD樣受體（NLR）信號基因。NLRs是一類主要的胞漿內模式識別受體（PRR），與細胞表面Toll樣受體一樣，識別多種多樣的病原微生物和免疫原性生物產物。PRR四個家庭成員（AIM2、NLRC4/IPAF、NLRP1和NLRP3）中任何一個的激活，都將引起炎性體的形成。而這些蛋白質復合物又反向激活caspase-1，使促炎性細胞因子IL1B、IL18和pyroptosis上調，從而導致炎癥壞死，以及caspase-1依賴的程序性細胞死亡。芯片包括編碼炎性體組件的基因、炎性體功能發揮的下游信號和抑制基因、其他NLR家庭成員，以及可能形成更多的炎性體和其下游信號的基因。通過實時定量PCR的方法，研究者即能夠利用該芯片簡單可靠地同時檢測炎性體和NLR功能和信號相關的基因表達。Inflammasomes PCR Array Inflammasomes: AIM2: AIM2, CASP1 (ICE), PYCARD (ASC). IPAF: CASP1, NAIP, NLRC4 (IPAF), PYCARD (ASC). NLRP1: CASP1 (ICE), CASP5, NLRP1. NLRP3: CASP1 (ICE), NLRP3, PYCARD (ASC). Negative Regulation: BCL2, BCL2L1 (BCL-X), CARD18 (ICEBERG), CD40LG (TNFSF5), CTSB, HSP90AA1, HSP90AB1, HSP90B1 (TRA1), MEFV, PSTPIP1, PYDC1 (POP1), SUGT1, TNF, TNFSF11, TNFSF14, TNFSF4 (OX40L). Downstream Signaling: IFNG, IL12A, IL12B, IL18, IL1B, IL33, IRAK1, IRF1, MYD88, P2RX7, PANX1, PTGS2 (COX2), RAGE, RIPK2, TIRAP, TXNIP. NOD-Like Receptors: Receptors: CIITA, NAIP (BIRC1), NLRC4 (IPAF), NLRC5, NLRP1, NLRP12, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6, NLRP9, NLRX1, NOD1 (CARD4), NOD2. Downstream Signaling: BIRC2 (c-IAP2), BIRC3 (c-IAP1), CARD6, CASP8 (FLICE), CCL2 (MCP-1), CCL5 (RANTES), CCL7 (MCP-3), CFLAR (CASPER), CHUK (IKKa), CXCL1, CXCL2, FADD, IFNB1, IKBKB, IKBKG, IL6, IRF1, IRF2, MAP3K7 (TAK1), MAPK1 (ERK2), MAPK11, MAPK12, MAPK13, MAPK3 (ERK1), MAPK8 (JNK1), MAPK9 (JNK2), NFKB1, NFKBIA (I?Ba/MAD3), NFKBIB (TRIP9), PEA15, RELA, RIPK2, SUGT1, TAB1 (MAP3K7IP1), TAB2 (MAP3K7IP2), TNF, TRAF6, XIAP. Pro-Inflammatory Caspases: CASP1 (ICE), CASP5. |
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