《年轻的女教师》3|《年轻护士2》中文字幕|《年轻女教师3》在线HD|年轻的妺妺5伦理HD国语字幕|年轻护士3的滋味|年轻的小妺妺伦理HD火车

eccDNAdb:染色體外環狀DNA數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2023-04-03
通過整合基因表達、臨床信息和染色質可訪問性數據,eccDNAdb使用戶能夠輕松確定eccDNA在人類癌癥中的生物學功能和臨床相關性......


染色體外環狀DNA(Extrachromosomal circular DNA,eccDNA)是源自但獨立于染色體DNA的環狀DNA分子,在癌癥中的普遍存在,并且在癌基因擴增和腫瘤進展中起關鍵作用。通過全基因組測序(WGS)可以鑒定eccDNA(本公司提供WGS測序服務)。eccDNAdb使用TCGA和CCLE下載的基因表達和臨床數據研究eccDNA在癌癥中的作用。eccDNAdb目前包括1270個eccDNA,在分析了包括患者組織、患者來源的異種移植物和癌細胞系在內的總共3395個腫瘤樣本(57種癌癥)后,在480個樣本(42種癌癥)中鑒定了這些eccDNA。共有54901個eccDNA基因被注釋并包含在數據庫中。通過整合基因表達、臨床信息和染色質可訪問性數據,eccDNAdb使用戶能夠輕松確定eccDNA在人類癌癥中的生物學功能和臨床相關性。http://www.eccdnadb.org/



l  Browse

在該模塊可以瀏覽eccDNA信息,如:測序樣本、疾病、eccDNA染色體位置來源等。



點擊“ID”跳轉至詳細信息界面,可以進一步了解eccDNA在不同疾病、細胞中的表達情況。



l  Search

該模塊可以根據用戶需求使用不同關鍵詞進行搜索:eccDNA ID,基因名、癌癥類型、樣本類型



以“Cancer”為例,輸入癌癥名稱如“Breast cancer”,點擊“Search”后在頁面下方顯示搜索結果:




l  GB

該模塊可以對不同癌癥樣本中含有eccDNA的區域的染色質可及性進行可視化。



乐都县| 隆德县| 黎平县| 宿州市| 惠水县| 新安县| 竹山县| 龙泉市| 都江堰市| 云梦县| 海林市| 安宁市| 旅游| 贵港市| 四平市| 安龙县| 香港 | 崇左市| 宜良县| 彰化县| 分宜县| 潢川县| 天台县| 任丘市| 轮台县| 台南市| 丁青县| 阳新县| 新和县| 潼南县| 肇州县| 汉川市| 泸溪县| 甘南县| 澄迈县| 临潭县| 朝阳县| 德阳市| 涟源市| 镇平县| 胶南市|