《年轻的女教师》3|《年轻护士2》中文字幕|《年轻女教师3》在线HD|年轻的妺妺5伦理HD国语字幕|年轻护士3的滋味|年轻的小妺妺伦理HD火车

LncPep:lncRNA編碼肽段數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2022-05-27
LncPep共涵蓋 39 個不同物種的883,804個lncRNA 翻譯的10,580,228個肽段。肽段預測應用了質譜、核糖體分析......


長鏈非編碼 RNA (lncRNA) 是一種大于 200 個核苷酸的轉錄物,已被證明在多個物種中發揮強大的調節功能,通常缺乏編碼蛋白質的能力。然而,越來越多的證據表明 lncRNA 能夠編碼在生物過程和疾病中發揮相關活性的肽。

LncPep (http://www.shenglilabs.com/LncPep/)共涵蓋 39 個不同物種的883,804個lncRNA 翻譯的10,580,228個肽段。肽段預測應用了質譜、核糖體分析、Pfam、翻譯起始位點、RNA 位點的 N6-甲基腺苷修飾、CPC2 和 CPAT 的方法。

                                               


l  Browse



選擇感興趣的物種,如“Human”,選擇編碼肽預測方式,點擊”Sort“后,將在下方顯示該物種特定預測方式下所有編碼肽段的lncRNA。

點擊結果中藍色的信息,可以獲得lncRNA/肽的詳細信息。


l  Validated



該模塊展示了有文獻支持的編碼肽的lncRNA,點擊PMID可以跳轉到文獻。

l  Search



該模塊提供了4種搜索方式:通過lncRNA/宿主基因/染色體位置/編碼預測方式進行搜索。



l  Predict


輸入1000bp以內的fasta格式lncRNA序列,選擇相應物種,點擊“Predict“,將在下方顯示預測結果:



l  Blast


輸入1000bp以內的fasta格式lncRNA序列或者肽,選擇相應物種,點擊“Blast“,將在下方顯示預測結果,點擊”link“查看詳細信息:



运城市| 习水县| 鲜城| 衡南县| 新龙县| 历史| 大兴区| 子长县| 巴彦淖尔市| 桐柏县| 永修县| 浑源县| 云林县| 保康县| 塔河县| 马龙县| 封丘县| 江阴市| 盐源县| 宣化县| 永城市| 定西市| 连南| 仙居县| 石渠县| 舟曲县| 广西| 佛坪县| 洱源县| 洪雅县| 甘谷县| 抚远县| 高青县| 凌源市| 淮北市| 墨江| 思茅市| 鄱阳县| 宣武区| 宜阳县| 库车县|