基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)的基本思想是使用預定義的基因集（通常來自功能注釋或先前實驗的結果），將基因按照在兩類樣本中的差異表達程度排序，然后檢驗預先設定的基因集合是否在這個排序表的頂端或者底端富集。基因集合富集分析檢測基因集合而不是單個基因的表達變化，因此可以包含這些細微的表達變化，預期得到更為理想的結果。

一、點擊“Molecular Signatures Database”，然后點擊“Search Gene Sets”，出現如下界面：

二、在“Keywords”中輸入想要查詢的方向，如免疫反應“IMMUNE_RESPONSE”。點擊“search”,出現查詢結果，這里顯示免疫反應基因集合，有235個免疫反應基因：

三、點擊“IMMUNE_RESPONSE”，頁面跳轉到詳細信息，然后選擇“gmt”格式下載：

四、數據下載完成之后，我們可以根據自己需要的系統版本，下載GSEA軟件（下載地址: https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp），然后進一步對數據進行分析:

今天的分享就到這里啦，希望能幫到苦心科研的你，我們下次再見！